Suomen Atlantti-Seuralla on puheenjohtaja, kaksi varapuheenjohtajaa, hallitus ja pääsihteeri.
Suomen Atlantti-Seuran ensimmäinen puheenjohtaja oli ministeri Jaakko Iloniemi (1999-2001). Hänen jälkeensä yhdistyksen puheenjohtajina ovat toimineet ministeri Paavo Rantanen (2002-2004), Elinkeinoelämän Valtuuskunnan johtaja, tohtori Risto E. J. Penttilä (2005-2008) sekä ministeri Liisa Jaakonsaari (2009-2023). Ministerit Iloniemi, Rantanen ja Jaakonsaari on kutsuttu yhdistyksen kunniapuheenjohtajiksi.
H A L L I T U S 2 0 2 5
Puheenjohtaja
Pankinjohtaja, entinen Euroopan komission varapuheenjohtaja ja pääministeri Jyrki Katainen
Varapuheenjohtajat
EU- ja ulkopolitiikan asiantuntija Jari Haapiainen
Toimitusjohtaja (Patria) Esa Rautalinko
Hallituksen jäsenet
Executive Vice President (Konecranes) Minna Aila
Kansainvälisen politiikan professori Tuomas Forsberg
Kansanedustaja, Yhdysvaltain politiikan tutkija Jani Kokko
Suurlähettiläs Klaus Korhonen
Puolustusministeriön ylijohtaja Janne Kuusela
Kansanedustaja, kenraali evp Jarmo Lindberg
Journalisti, HS Säätiön yliasiamies Laura Saarikoski
Valtiosihteeri Riikka Slunga-Poutsalo
Senior Advisor Stefan Wallin
Puolustusvoimien viestintäjohtaja, kommodori Kaarle Wikström
Pääsihteeri
Valtiotieteen maisteri Terhi Suominen
